RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 CHST12Q9NRB3 414 aa23.37■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 MYO9BQ13459 2157 aa23.37■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 DTNBO60941 627 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 LYPLA2O95372 231 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 RFC5P40937 340 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 RABEP1Q15276 862 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 CALCRLQ16602 461 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 C8orf76Q96K31 380 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 TTC3P53804 2025 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 FAM205CA6NFA0 338 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 NEMFO60524 1076 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 COL19A1Q14993 1142 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 NLRP7Q8WX94 980 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 MTMR9Q96QG7 549 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 LXNQ9BS40 222 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 AAASQ9NRG9 546 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 DACT1Q9NYF0 836 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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SIKE1-204ENST00000462123 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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SIKE1-204ENST00000462123 CEP170P1Q96L14 293 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 SCLT1Q96NL6 688 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 SIP14410 1827 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 A0A0U1RQF3 1178 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 ASAP2O43150 1006 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 SLITRK3O94933 977 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
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SIKE1-204ENST00000462123 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.33■■□□□ 1.33
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SIKE1-204ENST00000462123 TCP11Q8WWU5 503 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.33■■□□□ 1.33
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SIKE1-204ENST00000462123 ST18O60284 1047 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 SKIP12755 728 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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SIKE1-204ENST00000462123 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 KIF3AQ9Y496 699 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 A0A087WZ62 844 aa23.3■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.3■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.3■■□□□ 1.32
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SIKE1-204ENST00000462123 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.3■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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SIKE1-204ENST00000462123 CARNS1A5YM72 827 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TXKP42681 527 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 POU5F1BQ06416 359 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TPH2Q8IWU9 490 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF623O75123 536 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 ITGB1P05556 798 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 LAG3P18627 525 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 MCM2P49736 904 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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