RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 STK24Q9Y6E0 443 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 DRP2Q13474 957 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 FAM228AQ86W67 206 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM143Q96AN5 459 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB39O15060 712 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 17
SCAF8-204ENST00000461219 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF410Q86VK4 478 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 CEP89Q96ST8 783 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.85■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 A0A087WZ62 844 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LINC01553A4QN01 128 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LYPLA2O95372 231 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.255e-6■□□□□ 9.5
SCAF8-204ENST00000461219 BRAPQ7Z569 592 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 FIBCD1Q8N539 461 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 PPM1EQ8WY54 764 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 NACC1Q96RE7 527 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TMX1Q9H3N1 280 aa22.84■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 MED24O75448 989 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 DGAT1O75907 488 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 RPA1P27694 616 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 KSR1Q8IVT5 923 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 A0A087WWV3 80 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 RFXAPO00287 272 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ASAP2O43150 1006 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF15O94989 841 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.246e-8■□□□□ 8.2
SCAF8-204ENST00000461219 FGFR4P22455 802 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PRPHP41219 470 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 TFDP1Q14186 410 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PDIA5Q14554 519 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 KRT79Q5XKE5 535 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 POTEGQ6S5H5 508 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 FERMT3Q86UX7 667 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SAMD11Q96NU1 681 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 RGS18Q9NS28 235 aa22.82■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MGEA5O60502 916 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 RARRES1P49788 294 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ERVK-21P61565 698 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SNX21Q969T3 373 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 DACT1Q9NYF0 836 aa22.81■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PHKA2P46019 1235 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 RNF169Q8NCN4 708 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.8■■□□□ 1.24
SCAF8-204ENST00000461219 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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