RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 NME8Q8N427 588 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL13Q8N6R0 699 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 USP38Q8NB14 1042 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 SEPT8Q92599 483 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 TOP1MTQ969P6 601 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 GINS2Q9Y248 185 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01553A4QN01 128 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 TLL1O43897 1013 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 DSC3Q14574 896 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB30Q15771 203 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 IER5Q5VY09 327 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 RSPH3Q86UC2 560 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 TPH2Q8IWU9 490 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf19Q8IY42 314 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM167AQ96KS9 214 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 LXNQ9BS40 222 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 POLD4Q9HCU8 107 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0C4DFX4 3053 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WZ62 844 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 PP2D1A8MPX8 630 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 STK25O00506 426 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEB2O15479 319 aa7.85□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDC25AP30304 524 aa7.85□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.85□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR52Z1P0C646 297 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-206ENST00000461017 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 RARRES1P49788 294 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIN1Q05586 938 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 XKR9Q5GH70 373 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK18Q7Z418 384 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-206ENST00000461017 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.84□□□□□ -1.15
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