RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460668.5

STX4-204, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 3

Gene STX4, Length 842 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-204ENST00000460668 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 ANKEF1Q9NU02 776 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 COL4A6Q14031 1691 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 DSC3Q14574 896 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 RHPN2Q8IUC4 686 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 SCLT1Q96NL6 688 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 ADAM2Q99965 735 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 TUFT1Q9NNX1 390 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 RGS18Q9NS28 235 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 A0A087WZ62 844 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 MED24O75448 989 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 IGFBP4P22692 258 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 EMC2Q15006 297 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 KSR1Q8IVT5 923 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 TMEM143Q96AN5 459 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 A0A087WWV3 80 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 DENND3A2RUS2 1198 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 DGKIO75912 1065 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 15.6
STX4-204ENST00000460668 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 ZNF410Q86VK4 478 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 PIGOQ8TEQ8 1089 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.35■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 NLRC5Q86WI3 1866 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 C9IYK1 514 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 GAS2O43903 313 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 LPXNO60711 386 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 FGFR4P22455 802 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 RPA1P27694 616 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 RARRES1P49788 294 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 SLC24A5Q71RS6 500 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 ERMNQ8TAM6 284 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.34■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 LAD1O00515 517 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 STAG3L1P0CL83 205 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 GRB10Q13322 594 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 PDIA5Q14554 519 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 IL17AQ16552 155 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 NLRP4Q96MN2 994 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 MTRQ99707 1265 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.33■■□□□ 1.97
STX4-204ENST00000460668 EYSQ5T1H1 3165 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 PRPHP41219 470 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 FAM189BP81408 668 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 FIBCD1Q8N539 461 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 TCP11Q8WWU5 503 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 DGAT1O75907 488 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 LINC00271P0C7V0 271 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 POTEGQ6S5H5 508 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 FERMT3Q86UX7 667 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 GDPD5Q8WTR4 605 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 SNX21Q969T3 373 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 SAMD11Q96NU1 681 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 NACC1Q96RE7 527 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 LRFN2Q9ULH4 789 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.31■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 ASAP2O43150 1006 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 MUTP22033 750 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 ECM1Q16610 540 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 EPC2Q52LR7 807 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 TMEM192Q8IY95 271 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 TRANK1O15050 2925 aa27.3■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 PDCP20941 246 aa27.29■■□□□ 1.96
STX4-204ENST00000460668 GATMP50440 423 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms