RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MYMKA6NI61 221 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GUCY2CP25092 1073 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CLCN3P51790 818 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 FAAP100Q0VG06 881 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MAPK7Q13164 816 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SV2BQ7L1I2 683 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GPBP1Q86WP2 473 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DAW1Q8N136 415 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 RETREG2Q8NC44 543 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 STAMQ92783 540 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KCND2Q9NZV8 630 aa11.38□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TAF2Q6P1X5 1199 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 RPAINQ86UA6 219 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 METTL13Q8N6R0 699 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GPT2Q8TD30 523 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TCP11Q8WWU5 503 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM143Q96AN5 459 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 PAGE5Q96GU1 130 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TIGD1Q96MW7 591 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 REEP2Q9BRK0 252 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TIPINQ9BVW5 301 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DACT1Q9NYF0 836 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 NOD1Q9Y239 953 aa11.37□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 HIP1RO75146 1068 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CLTBP09497 229 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 RSPH10BP0C881 870 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ARL2P36404 184 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 RBL2Q08999 1139 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GIT2Q14161 759 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 IER5Q5VY09 327 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DYMQ7RTS9 669 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CNNM3Q8NE01 707 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DDX12PQ92771 950 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM9Q9C026 710 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 POLD4Q9HCU8 107 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TBX21Q9UL17 535 aa11.36□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KINO60870 393 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 VTNP04004 478 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GLRA2P23416 452 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TMOD1P28289 359 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CASP1P29466 404 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 THPOP40225 353 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 AFMP43652 599 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DNM2P50570 870 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 GPC3P51654 580 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 AMPD3Q01432 767 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MGAT3Q09327 533 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CUL4BQ13620 913 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 FAM26DQ5JW98 314 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KSR1Q8IVT5 923 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 NME8Q8N427 588 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 BSNDQ8WZ55 320 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KIFAP3Q92845 792 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DRC1Q96MC2 740 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MAP7D2Q96T17 732 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 AKT3Q9Y243 479 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SCN5AQ14524 2016 aa11.35□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.34□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA0355O15063 1070 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms