RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.64□□□□□ -0.87
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SH3BP1-204ENST00000459646 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.64□□□□□ -0.87
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SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP1-204ENST00000459646 EVCP57679 992 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMC5P62195 406 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 CDC42EP1Q00587 391 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 COL19A1Q14993 1142 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 GALNT17Q6IS24 598 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-204ENST00000459646 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB33Q86T24 672 aa9.61□□□□□ -0.87
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