RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYN1	P17600	705 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIG1	P18858	919 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2C18	P33260	490 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCL23	P55773	120 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARSH	Q5FYA8	562 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KSR1	Q8IVT5	923 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCND2	Q9NZV8	630 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP25	Q9UHP3	1055 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBX21	Q9UL17	535 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	EVPL	Q92817	2033 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARID2	Q68CP9	1835 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYMK	A6NI61	221 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SFI1	A8K8P3	1242 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR1I2	O75469	434 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RSPH10B	P0C881	870 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLRP7	Q8WX94	980 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX12P	Q92771	950 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DRC1	Q96MC2	740 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLRP4	Q96MN2	994 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNMD	Q9H2S6	317 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PITPNM1	O00562	1244 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0355	O15063	1070 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIMP1	P01033	207 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SELP	P16109	830 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GUCY2C	P25092	1073 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL2	P36404	184 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPAIN	Q86UA6	219 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIFAP3	Q92845	792 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAGE5	Q96GU1	130 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCLY	Q96I15	445 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFT74	Q96LB3	600 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	REEP2	Q9BRK0	252 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALPK3	Q96L96	1907 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASAP2	O43150	1006 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAND2	O75155	1236 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM13A	O94988	1023 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHRNA1	P02708	482 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	IDE	P14735	1019 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGB8	P26012	769 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RGS19	P49795	217 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDC42EP1	Q00587	391 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GIT2	Q14161	759 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF149	Q8NC42	400 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DACT1	Q9NYF0	836 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A087WZ62	844 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC169	A6NNP5	214 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR32	O75388	356 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCF3	P0C7M6	154 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLRA2	P23416	452 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASP1	P29466	404 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCM4	P33991	863 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPC3	P51654	580 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PEX3	P56589	373 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASIC1	P78348	528 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TFDP1	Q14186	410 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KANK3	Q6NY19	840 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYCT1	Q8N699	235 aa		15.16	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms