RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-203ENST00000429490 C18orf8Q96DM3 657 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 THAP2Q9H0W7 228 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SCTRP47872 440 aa14.84□□□□□ -0.03
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SGMS1-203ENST00000429490 TEKT1Q969V4 418 aa14.84□□□□□ -0.03
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SGMS1-203ENST00000429490 BTBD6Q96KE9 485 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 NARFQ9UHQ1 456 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 BCL9O00512 1426 aa14.84□□□□□ -0.03
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SGMS1-203ENST00000429490 ATP2B4P23634 1241 aa14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 JAMLQ86YT9 394 aa14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 POTEJP0CG39 1038 aa14.83□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 SOX5P35711 763 aa14.83□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.83□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.83□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 SUFUQ9UMX1 484 aa14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.83□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.82□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.82□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 COG2Q14746 738 aa14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.81□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.81□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 CNPY4Q8N129 248 aa14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 HAS1Q92839 578 aa14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
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