RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428954.1

AL080248.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL080248.1, Length 388 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL080248.1-201ENST00000428954 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 KCNK18Q7Z418 384 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 HIPK4Q8NE63 616 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 RUNDC1Q96C34 613 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 MYL10Q9BUA6 226 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 KCNG1Q9UIX4 513 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 ASB1Q9Y576 335 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 KCTD3Q9Y597 815 aa4.73□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 OR14I1A6ND48 311 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 HRKO00198 91 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 AP1G1O43747 822 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 TRIM27P14373 513 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PNLIPP16233 465 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 FAHP16930 419 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 AKAP5P24588 427 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 AOAHP28039 575 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 ARL4AP40617 200 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 GALEQ14376 348 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 BRD3Q15059 726 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 TTC38Q5R3I4 469 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 MIER2Q8N344 545 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SVIPQ8NHG7 77 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 FERMT2Q96AC1 680 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PEX11GQ96HA9 241 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 TAAR9Q96RI9 348 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SARGQ9BW04 601 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 CSRNP2Q9H175 543 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 BTBD7Q9P203 1132 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
AL080248.1-201ENST00000428954 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 F8W031 263 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 NDUFS2O75306 463 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 OFD1O75665 1012 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 APOL3O95236 402 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 PRLP01236 227 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 CYBBP04839 570 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 MC4RP32245 332 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 THBS2P35442 1172 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 MYBPC3Q14896 1274 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 SMC5Q8IY18 1101 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 MAML3Q96JK9 1138 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.71□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 ZBTB7AO95365 584 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 POU2F2P09086 479 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 MTHFD2P13995 350 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 SYN1P17600 705 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 SDHBP21912 280 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 SLC6A3Q01959 620 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 NFIXQ14938 502 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 MUM1Q2TAK8 710 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 IL31Q6EBC2 164 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 CYB5RLQ6IPT4 315 aa4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
AL080248.1-201ENST00000428954 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms