RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 ADAM2Q99965 735 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 AKT3Q9Y243 479 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NEMFO60524 1076 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 MCM7P33993 719 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PSMC5P62195 406 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 XKR3Q5GH77 459 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 MTMR9Q96QG7 549 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 HCSTQ9UBK5 93 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 MAGEB2O15479 319 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 GJB2P29033 226 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TXKP42681 527 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 EPHA7Q15375 998 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF174Q15697 407 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 MTERF2Q49AM1 385 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 MAP7D2Q96T17 732 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 CD320Q9NPF0 282 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 CLDND1Q9NY35 253 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 RGL1Q9NZL6 768 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 GPR182O15218 404 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 DNAJB1P25685 340 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 ANO5Q75V66 913 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 DYDC2Q96IM9 177 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PLVAPQ9BX97 442 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 RGS18Q9NS28 235 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 C9IYK1 514 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 ITGB1P05556 798 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 FGFR1P11362 822 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 HYAL1Q12794 435 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 DRP2Q13474 957 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 CAMK1Q14012 370 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NBR1Q14596 966 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 NEK9Q8TD19 979 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 CEP89Q96ST8 783 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 KIF3AQ9Y496 699 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-204ENST00000428946 TMOD1P28289 359 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 IRS1P35568 1242 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 NPEPPSP55786 919 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 CYP4A11Q02928 519 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 CLUL1Q15846 466 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 TTC38Q5R3I4 469 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 ODR4Q5SWX8 454 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 TPH2Q8IWU9 490 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 SCLT1Q96NL6 688 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 LXNQ9BS40 222 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 IGFLR1Q9H665 355 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 ZBTB39O15060 712 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 LINC01565O15544 149 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 SLITRK3O94933 977 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 COL9A1P20849 921 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 FGFR4P22455 802 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-204ENST00000428946 DSC3Q14574 896 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms