RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GYS2P54840 703 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEMA3FQ13275 785 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACAD11Q709F0 780 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MASTLQ96GX5 879 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DONSONQ9NYP3 566 aa15.95■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYBL1P10243 752 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFKBIAP25963 317 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TFDP2Q14188 446 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEP19Q96LK0 163 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYP26B1Q9NR63 512 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNFAIP2Q03169 654 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYTH2Q99418 400 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPHB1P54762 984 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSC22D3Q99576 134 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LAMC1P11047 1609 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SFI1A8K8P3 1242 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR29P0C7W0 189 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RXRBP28702 533 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHRNA3P32297 505 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCA8O94911 1581 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GMNCA6NCL1 334 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO1CO00159 1063 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CIITAP33076 1130 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SUN2Q9UH99 717 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM187AA6NFU0 413 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNAP25P60880 206 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXO40Q9UH90 709 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KDM6BO15054 1643 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUP85Q9BW27 656 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PALLDQ8WX93 1383 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP17L5A8MUK1 530 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GGPS1O95749 300 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNH2Q12809 1159 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SUSD4Q5VX71 490 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LY9Q9HBG7 655 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POTEMA6NI47 508 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASNSP08243 561 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRM4Q14833 912 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NLRP14Q86W24 1093 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHUKO15111 745 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HAUS5O94927 633 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FEM1BQ9UK73 627 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COPS2P61201 443 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EXT2Q93063 718 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTMR1Q13613 665 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNF8Q96H20 258 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCNAQ96QF7 691 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGDIAP52565 204 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q3C1V9 767 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms