RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 OSBPP22059 807 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PMS2P54278 862 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 USP14P54578 494 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 LGALS16A8MUM7 142 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 HSPA4LO95757 839 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 OCRLQ01968 901 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 IQCB1Q15051 598 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 NRBF2Q96F24 287 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CPS1P31327 1500 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 COPEO14579 308 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CCNA1P78396 465 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FAM161BQ96MY7 647 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 EXT2Q93063 718 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HAUS5O94927 633 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CEP19Q96LK0 163 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PODXLO00592 558 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PFDN6O15212 129 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MCF2P10911 925 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HACE1Q8IYU2 909 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC63Q05C16 580 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HSPH1Q92598 858 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PRCPP42785 496 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ANO9A1A5B4 782 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 C7orf31Q8N865 590 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BRAFP15056 766 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CDO1Q16878 200 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 OSTNP61366 133 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CDR2Q01850 454 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SP8Q8IXZ3 490 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZBED1O96006 694 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 COG1Q8WTW3 980 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF711Q9Y462 761 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PTPREP23469 700 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2C19P33261 490 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PSMD2Q13200 908 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SLC15A2Q16348 729 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB33Q86T24 672 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FAF2Q96CS3 445 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PARVGQ9HBI0 331 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FAM196BA6NMK8 535 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ARL4AP40617 200 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PRPSAP2O60256 369 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BMP3P12645 472 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms