RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 HOXC6P09630 235 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NTF4P34130 210 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 HERVK_113P62684 666 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 HID1Q8IV36 788 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 LPIN2Q92539 896 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SIL1Q9H173 461 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CERS4Q9HA82 394 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 GMIPQ9P107 970 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PLXNA3P51805 1871 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PTPRCP08575 1304 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SEPT4O43236 478 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 IL9P15248 144 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ADORA1P30542 326 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PHKA1P46020 1223 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 GSK3AP49840 483 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP2B3Q16720 1220 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM87BQ96K49 555 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NACC1Q96RE7 527 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PIF1Q9H611 641 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 USP40Q9NVE5 1235 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A1W2PQH9 124 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A1W2PQY0 241 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 FGBP02675 491 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NFICP08651 508 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 RGS3P49796 1198 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 RAB33AQ14088 237 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 KCTD2Q14681 263 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SGO2Q562F6 1265 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 TNNI3KQ59H18 835 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 TTC6Q86TZ1 520 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM199Q8N511 208 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC9A7Q96T83 725 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 KIF2CQ99661 725 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PRRX2Q99811 253 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CEP41Q9BYV8 373 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 IL23AQ9NPF7 189 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PARP14Q460N5 1801 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PROB1E7EW31 1015 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 LPXNO60711 386 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CNMDO75829 334 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 CIAO1O76071 339 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 DDAH1O94760 285 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 GUCY2CP25092 1073 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 GRB10Q13322 594 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PICALMQ13492 652 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 RASGRF1Q13972 1273 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 MBTPS1Q14703 1052 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOGP4-201ENST00000427230 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms