RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427196.1

HCG25-218, Transcript of HLA complex group 25, humanhuman

TSL 2

Gene HCG25, Length 677 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG25-218ENST00000427196 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CDC25AP30304 524 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 JAK3P52333 1124 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CHMP4BP1P59074 171 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PSMC6P62333 389 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 KRT85P78386 507 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PDIA5Q14554 519 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 EPHA7Q15375 998 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 UGCGQ16739 394 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DGKDQ16760 1214 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPECC1Q5M775 1068 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ATL3Q6DD88 541 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 RPAINQ86UA6 219 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 BANK1Q8NDB2 785 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 KAT2BQ92831 832 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SLC9A7Q96T83 725 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 RGL1Q9NZL6 768 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CFAP45Q9UL16 551 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 FAM50BQ9Y247 325 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 GRIN2DO15399 1336 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 A0A087WWV3 80 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 H3BRB1 525 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 BACH1O14867 736 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MBTPS2O43462 519 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ZNF862O60290 1169 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ZEB2O60315 1214 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 KPNA6O60684 536 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PPP6R2O75170 966 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MED24O75448 989 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SLITRK3O94933 977 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 STBD1O95210 358 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ATP4AP20648 1035 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MARK3P27448 753 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SFNP31947 248 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PSEN2P49810 448 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 STAT5BP51692 787 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CYP4A11Q02928 519 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 USP49Q70CQ1 688 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DCLK2Q8N568 766 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 RDM1Q8NG50 284 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 GLG1Q92896 1179 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DYDC2Q96IM9 177 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPATA32Q96LK8 384 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CSRNP2Q9H175 543 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ZNF302Q9NR11 478 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 COL4A3Q01955 1670 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 EMSYQ7Z589 1322 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TMEM150BA6NC51 233 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 HAS3O00219 553 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ZBTB39O15060 712 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 B4GALT4O60513 344 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CUTAO60888 179 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 F2P00734 622 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LTBRP36941 435 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms