RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 HOXA2O43364 376 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 FGFR1P11362 822 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 XBP1P17861 261 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R5CQ13362 524 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ADAM15Q13444 863 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 RNF19AQ9NV58 838 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 VAV3Q9UKW4 847 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CTDNEP1O95476 244 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CDC42EP1Q00587 391 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ZP2Q05996 745 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 DRP2Q13474 957 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD1Q15327 319 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 LETM2Q2VYF4 491 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 MTERF2Q49AM1 385 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 NEK8Q86SG6 692 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 EFHBQ8N7U6 833 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 FAM20AQ96MK3 541 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CWH43Q9H720 699 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 HCSTQ9UBK5 93 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM150BA6NC51 233 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 LINC01565O15544 149 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CSPG5O95196 566 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 LAG3P18627 525 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 AK2P54819 239 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PSMC5P62195 406 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 EML1O00423 815 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 TBX3O15119 743 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 MBTPS2O43462 519 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 GPR37L1O60883 481 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 FGF18O76093 207 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ANO5Q75V66 913 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP7Q8WX94 980 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 CASD1Q96PB1 797 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 IGFLR1Q9H665 355 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 LZTS1Q9Y250 596 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 A0A0U1RQF3 1178 aa23.39■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF410Q86VK4 478 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC43Q8N309 656 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 OXER1Q8TDS5 423 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 WASF1Q92558 559 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 SCLT1Q96NL6 688 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 TLR9Q9NR96 1032 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CD207Q9UJ71 328 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 EYA4O95677 639 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 GLP2RO95838 553 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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UBXN4-204ENST00000426921 PLCB3Q01970 1234 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 HAS1Q92839 578 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CHST12Q9NRB3 414 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 DACT1Q9NYF0 836 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CLEC1BQ9P126 229 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 PPME1Q9Y570 386 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 C5orf42Q9H799 3197 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 FSD2A1L4K1 749 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 FSCN2O14926 492 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 EOMESO95936 686 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 FGFR4P22455 802 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 NRIP1P48552 1158 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN4-204ENST00000426921 NDUFV1P49821 464 aa23.37■■□□□ 1.33
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