RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PHKA2P46019 1235 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ELF2Q15723 593 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 INAQ16352 499 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 VWA3BQ502W6 1294 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 C16orf87Q6PH81 154 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 RINLQ6ZS11 566 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MLKLQ8NB16 471 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM20AQ96MK3 541 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CARD6Q9BX69 1037 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CUEDC2Q9H467 287 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MYO1CO00159 1063 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K7O43318 606 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GGPS1O95749 300 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GNA14O95837 355 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MMP1P03956 469 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 NR3C2P08235 984 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DLATP10515 647 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT3P12035 628 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 RASA1P20936 1047 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFAIP3P21580 790 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 STX2P32856 288 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCB3Q01970 1234 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MYL5Q02045 173 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM14Q14142 442 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 E2F5Q15329 346 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT71Q3SY84 523 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 LIN9Q5TKA1 542 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT80Q6KB66 452 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 URGCPQ8TCY9 931 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 NEK9Q8TD19 979 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 P3H4Q92791 437 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC25Q9H1X3 360 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SUFUQ9UMX1 484 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DAPK3O43293 454 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ESRRBO95718 433 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC4O95801 387 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT9P35527 623 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TLK2Q86UE8 772 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC25Q86WR0 208 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP19Q96LK0 163 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 GCNAQ96QF7 691 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ACCSQ96QU6 501 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 DISC1Q9NRI5 854 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KNDC1Q76NI1 1749 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 STK25O00506 426 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 FKTNO75072 461 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 FGFR2P21802 821 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PTGS1P23219 599 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CPT1AP50416 773 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 STAT5BP51692 787 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 ARPP19P56211 112 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC42EP1Q00587 391 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPK6Q16659 721 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL29Q96CT2 875 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms