RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

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Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 RAB34Q9BZG1 259 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RIPK2O43353 540 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 HIP1RO75146 1068 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PDE6BP35913 854 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CLUL1Q15846 466 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 KRT79Q5XKE5 535 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 POTEMA6NI47 508 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PTGIRP43119 386 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SLCO1A2P46721 670 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC15Q0P6D6 951 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 NPTXRO95502 500 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 COPB2P35606 906 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PPATQ06203 517 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ADAM9Q13443 819 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 BARGINQ6ZT62 677 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PARP2Q9UGN5 583 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 IL2RBP14784 551 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PON1P27169 355 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 JAM2P57087 298 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RNF43Q68DV7 783 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 UNC5CO95185 931 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GALCP54803 685 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC14Q15048 493 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PARP6Q2NL67 630 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RARGP13631 454 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CALB2P22676 271 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SUSD4Q5VX71 490 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 FBF1Q8TES7 1133 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 LRRD1A4D1F6 860 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 CETN3O15182 167 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SLC37A4O43826 429 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 TOM1O60784 492 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GNAT1P11488 350 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ATP6V1C1P21283 382 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ECM1Q16610 540 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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CLDN5-201ENST00000403084 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ASB3Q9Y575 518 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 IRF6O14896 467 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PHF2O75151 1096 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GFPT2O94808 682 aa23.59■■□□□ 1.37
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CLDN5-201ENST00000403084 FGFR4P22455 802 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 VSTM1Q6UX27 236 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RFFLQ8WZ73 363 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.59■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM120BA0PK00 339 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 KLRF2D3W0D1 207 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 ACVR2BQ13705 512 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 SOGA3Q5TF21 947 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.58■■□□□ 1.37
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