RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 AFG1LQ8WV93 481 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 VPS16Q9H269 839 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 N4BP3O15049 544 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 MARK3P27448 753 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 PSMC4P43686 418 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 KSR1Q8IVT5 923 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 BSNDQ8WZ55 320 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.37■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 LGALS2P05162 132 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 CYP2C19P33261 490 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 RFC5P40937 340 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 NPTX2P47972 431 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 GTF2BQ00403 316 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 NFIL3Q16649 462 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN21Q16825 1174 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.36■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 NR2F2P24468 414 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 TNFAIP2Q03169 654 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 ADAM9Q13443 819 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 LGALS16A8MUM7 142 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 PPFIA4O75335 1185 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 CETN3O15182 167 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 SLC16A4O15374 487 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D8O95759 1140 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 GNA14O95837 355 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 ARL2P36404 184 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 SMTNP53814 917 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 MIIPQ5JXC2 388 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 GBP3Q9H0R5 595 aa22.34■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 HBP1O60381 514 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 NR3C1P04150 777 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 MMP3P08254 477 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM206Q9H813 350 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.33■■□□□ 1.17
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC169A6NNP5 214 aa22.32■■□□□ 1.16
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HDDC3-202ENST00000394272 MAP2K2P36507 400 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 GSDMDP57764 484 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CAP1Q01518 475 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM143Q96AN5 459 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 HVCN1Q96D96 273 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 GABRQQ9UN88 632 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.32■■□□□ 1.16
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HDDC3-202ENST00000394272 SP3Q02447 781 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 KCNN1Q92952 543 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 IFT74Q96LB3 600 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ACCSQ96QU6 501 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TRPC6Q9Y210 931 aa22.32■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CLIC2O15247 247 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 FLT3LGP49771 235 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 UBXN1Q04323 297 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ARID5BQ14865 1188 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 MAN2A1Q16706 1144 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.31■■□□□ 1.16
HDDC3-202ENST00000394272 SIP14410 1827 aa22.3■■□□□ 1.16
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