RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371281.3

TTC4-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC4, Length 2,395 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC4-201ENST00000371281 MYO6Q9UM54 1294 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ZNF862O60290 1169 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SLC9A1P19634 815 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 NF2P35240 595 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 NPEPPSP55786 919 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PPP2R5AQ15172 486 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 STXBP2Q15833 593 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 OTUD5Q96G74 571 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 DEF6Q9H4E7 631 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SIX2Q9NPC8 291 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 TFR2Q9UP52 801 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 AKR1B10O60218 316 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ACTN1P12814 892 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 CYP2J2P51589 502 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ACTR2P61160 394 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 AMPD2Q01433 879 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 CNTN2Q02246 1040 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PPIL2Q13356 520 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PJA2O43164 708 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 CNMDO75829 334 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 UCHL3P15374 230 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 EPHX2P34913 555 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 KIF5AQ12840 1032 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PEX10O60683 326 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 EDNRBP24530 442 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ASIC2Q16515 512 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 HVCN1Q96D96 273 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 GCNT4Q9P109 453 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 FMO5P49326 533 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PEX3P56589 373 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SP2Q02086 613 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 MOGSQ13724 837 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 MOB2Q70IA6 237 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 UBXN4Q92575 508 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 KIFAP3Q92845 792 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 MAPK13O15264 365 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SLC16A4O15374 487 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 EXOC3O60645 756 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ATG7O95352 703 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 JAM2P57087 298 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 FSTL1Q12841 308 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 CEP112Q8N8E3 955 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 CEP170P1Q96L14 293 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 MAGEA1P43355 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 PRKCEQ02156 737 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 BFSP1Q12934 665 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 SIP14410 1827 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 ANO9A1A5B4 782 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC4-201ENST00000371281 POTEB2H3BUK9 544 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms