RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 AGTP01019 485 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT31Q15323 416 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 BLIDQ8IZY5 108 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RIN3Q8TB24 985 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 AREL1O15033 823 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 HAUS5O94927 633 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RDH13Q8NBN7 331 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RASA4BC9J798 803 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 COPEO14579 308 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RASA4O43374 803 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ANP32DO95626 131 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CNBD1Q8NA66 436 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DACH2Q96NX9 599 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 COG4Q9H9E3 785 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TNKSO95271 1327 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 GNAT1P11488 350 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPK4P31152 587 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP10Q92851 521 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 EYA2O00167 538 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 E2F6O75461 281 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 EPAS1Q99814 870 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MTA3Q9BTC8 594 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NPR1P16066 1061 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PARVGQ9HBI0 331 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT6AP02538 564 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT6BP04259 564 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ARL4AP40617 200 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT6CP48668 564 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RESP18Q5W5W9 173 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PLD3Q8IV08 490 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF263O14978 683 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL2O95198 593 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 POLD1P28340 1107 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3CAP42336 1068 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MFN1Q8IWA4 741 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGED4Q96JG8 741 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PICK1Q9NRD5 415 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CIITAP33076 1130 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGDRQ13258 359 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 LONP2Q86WA8 852 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR91A4D1P6 747 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TMOD1P28289 359 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 17.8
SH3BP2-201ENST00000356331 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SSH3Q8TE77 659 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RGL1Q9NZL6 768 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFATQ9P243 1243 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPA4LO95757 839 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC1A4P43007 532 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 COPS2P61201 443 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBA4AP68366 448 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CD209Q9NNX6 404 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TOMM70O94826 608 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TECP42680 631 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MESDQ14696 234 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 STAT4Q14765 748 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 C4orf22Q6V702 233 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms