RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 COPS5Q92905 334 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 P2RX5Q93086 422 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GPR20Q99678 358 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 BICDL2A1A5D9 508 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FAM13AO94988 1023 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ATP1A3P13637 1013 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZNF18P17022 549 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCNE1P24864 410 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CTGFP29279 349 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 LRRC41Q15345 812 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SPATA33Q96N06 139 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PCYT2Q99447 389 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 POLD4Q9HCU8 107 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SFI1A8K8P3 1242 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 HIP1RO75146 1068 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 RGS2P41220 211 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ZNF131P52739 623 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FANCCQ00597 558 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TIPINQ9BVW5 301 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 PARVGQ9HBI0 331 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 LGR5O75473 907 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 OATP04181 439 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 HOXC6P09630 235 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ATP4AP20648 1035 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CDC25BP30305 580 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NPEPPSP55786 919 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP1Q07960 439 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ACVR2BQ13705 512 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 XKR3Q5GH77 459 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TTI2Q6NXR4 508 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MYCT1Q8N699 235 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GJD2Q9UKL4 321 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 GH1P01241 217 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAPK7Q13164 816 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CENPPQ6IPU0 288 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CEP170P1Q96L14 293 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TRIM47Q96LD4 638 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 APBA2Q99767 749 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 THAP9Q9H5L6 903 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 IFNKQ9P0W0 207 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.66□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SERPINC1P01008 464 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MYBP10242 640 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 STAT5BP51692 787 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CASP5P51878 434 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 FCGRTP55899 365 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 LAMC2Q13753 1193 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 CCL14Q16627 93 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 DAW1Q8N136 415 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-201ENST00000341935 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms