RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 UBE4BO95155 1302 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF286BP0CG31 522 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ARL2P36404 184 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 DNM2P50570 870 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 STRA6Q9BX79 667 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TSKSQ9UJT2 592 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.19■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NRCAMQ92823 1304 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 HAS3O00219 553 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 GCNT3O95395 438 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 MED15Q96RN5 788 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 POLD4Q9HCU8 107 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.18■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ASAP2O43150 1006 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ADAMTS4O75173 837 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 INHAP05111 366 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NCKAP1LP55160 1127 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PEX3P56589 373 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC41Q15345 812 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KAT2BQ92831 832 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 HVCN1Q96D96 273 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TSG101Q99816 390 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM206Q9H813 350 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.17■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PDXKO00764 312 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 MYL3P08590 195 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TMOD1P28289 359 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NAMPTP43490 491 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NPTX2P47972 431 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 GTF2BQ00403 316 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PPFIA1Q13136 1202 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TTI2Q6NXR4 508 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 WDR81Q562E7 1941 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PPP1R37O75864 691 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KLRC1P26715 233 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 STX17P56962 302 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 BEX3Q00994 111 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 MFSD10Q14728 455 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 RNF180Q86T96 592 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 FANCLQ9NW38 375 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.16■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 C22orf31O95567 290 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PGK1P00558 417 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 MYBP10242 640 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 GNAT1P11488 350 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PSEN2P49810 448 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CASP5P51878 434 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CDC42EP1Q00587 391 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 GRIK4Q16099 956 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM143Q96AN5 459 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 THAP9Q9H5L6 903 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.14■□□□□ 0.82
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC169A6NNP5 214 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 K7ENM7 598 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 CABYRO75952 493 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 POU5F1BQ06416 359 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 SARM1Q6SZW1 724 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.14■□□□□ 0.81
FRMD1-202ENST00000336070 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms