RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304743.6

PCNX1-201, Transcript of pecanex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 12,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-201ENST00000304743 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 PSAPP07602 524 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 GRK2P25098 689 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 RPS6KA3P51812 740 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 PGM3O95394 542 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 CYP2C19P33261 490 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 HORMAD1Q86X24 394 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 IFNKQ9P0W0 207 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 IL2RBP14784 551 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 GUCY1A3Q02108 690 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 H3BUI4 141 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 ADCY6O43306 1168 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 CCDC166P0CW27 439 aa8.6□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 BBS9Q3SYG4 887 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.6□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 ULK3Q6PHR2 472 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 FAM227BQ96M60 508 aa8.6□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 MYO10Q9HD67 2058 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 MTFR1Q15390 333 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 COPS6Q7L5N1 327 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 IPPQ9Y573 584 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 NUDT14O95848 222 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 PLD3Q8IV08 490 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 SIX5Q8N196 739 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 KBTBD13C9JR72 458 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 CPA3P15088 417 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 TRIM63Q969Q1 353 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 GMCL1Q96IK5 515 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-201ENST00000304743 IDI2Q9BXS1 227 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-201ENST00000304743 HSD3B1P14060 373 aa8.59□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 ICA1Q05084 483 aa8.59□□□□□ -1.04
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PCNX1-201ENST00000304743 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.59□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 CCT8P50990 548 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 IYDQ6PHW0 289 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 KLHL29Q96CT2 875 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-201ENST00000304743 USP40Q9NVE5 1235 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 PIK3R4Q99570 1358 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 ZBED1O96006 694 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 TAF13Q15543 124 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-201ENST00000304743 CDO1Q16878 200 aa8.58□□□□□ -1.04
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