RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 AHCYL1O43865 530 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 UPP2O95045 317 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 NFIAQ12857 509 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 TRAF1Q13077 416 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 SELENOSQ9BQE4 189 aa26.7■■□□□ 1.87
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PKDCC-201ENST00000294964 CUEDC2Q9H467 287 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.7■■□□□ 1.87
PKDCC-201ENST00000294964 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.7■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 ZFATQ9P243 1243 aa26.7■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 GGT7Q9UJ14 662 aa26.7■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 CEP104O60308 925 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 TLR2O60603 784 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 SNAP25P60880 206 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 AMPD3Q01432 767 aa26.69■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 TCP10Q12799 353 aa26.69■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.69■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 DDX12PQ92771 950 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 ECT2Q9H8V3 914 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 MYH4Q9Y623 1939 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 SLC30A9Q6PML9 568 aa26.68■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.68■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 USP17L15C9J2P7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 USP17L11C9JVI0 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 USP17L18D6R9N7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 USP17L19D6RCP7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 USP17L20D6RJB6 530 aa26.68■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 EVI5O60447 810 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 USP17L24Q0WX57 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 SLF2Q8IX21 1173 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 GOLPH3Q9H4A6 298 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 AMACRQ9UHK6 382 aa26.68■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.67■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 NEFHP12036 1026 aa26.67■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 KIF4AO95239 1232 aa26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 TTLL1O95922 423 aa26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 SERPING1P05155 500 aa26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 VIMP08670 466 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 SHMT1P34896 483 aa26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 MMP13P45452 471 aa26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF543Q08ER8 600 aa26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.66■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 CENPPQ6IPU0 288 aa26.66■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 DPH5Q9H2P9 285 aa26.66■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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PKDCC-201ENST00000294964 RAD54LQ92698 747 aa26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 STK38LQ9Y2H1 464 aa26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 UTRNP46939 3433 aa26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 A0A087X0T9 212 aa26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-201ENST00000294964 TTI1O43156 1089 aa26.65■■□□□ 1.86
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