RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 SLITRK3O94933 977 aa30.46■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 ATP1A2P50993 1020 aa30.46■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 MAATS1Q7Z4T9 603 aa30.46■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 KCND2Q9NZV8 630 aa30.46■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 PRR12Q9ULL5 1215 aa30.46■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 NDUFAB1O14561 156 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 PSMD10O75832 226 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 CCDC172P0C7W6 258 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 FMO5P49326 533 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 GALCP54803 685 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 LRCH2Q5VUJ6 765 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 CCDC26Q8TAB7 109 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 PIGOQ8TEQ8 1089 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 AP1M1Q9BXS5 423 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 TMBIM4Q9HC24 238 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 FRMPD4Q14CM0 1322 aa30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD65E5RJM6 399 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 TMEM253P0C7T8 217 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 NMT1P30419 496 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 HSD17B3P37058 310 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 CEP85LQ5SZL2 805 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 HS2ST1Q7LGA3 356 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 TPH2Q8IWU9 490 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 SLC5A5Q92911 643 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 BCAS3Q9H6U6 928 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 AMFRQ9UKV5 643 aa30.45■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 SFI1A8K8P3 1242 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ENTPD3O75355 529 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 LSP1P33241 339 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ZNF131P52739 623 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 MTMR3Q13615 1198 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R5AQ15172 486 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 DNAAF5Q86Y56 855 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 RFFLQ8WZ73 363 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 DYDC2Q96IM9 177 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 EPN3Q9H201 632 aa30.44■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 GH2P01242 217 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 OLIG1Q8TAK6 271 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 SEC14L1Q92503 715 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 WDR18Q9BV38 432 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ODF2LQ9ULJ1 636 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 EFCC1Q9HA90 598 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 DMAC2Q9NW81 257 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC12Q9UKB3 198 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa30.43■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 MYZAPP0CAP1 466 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PRELPP51888 382 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 STAT2P52630 851 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ZNF720Q7Z2F6 126 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 SYT11Q9BT88 431 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 POLD4Q9HCU8 107 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PSME4Q14997 1843 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 C21orf2O43822 256 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R37O75864 691 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 NACC1Q96RE7 527 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 FIZ1Q96SL8 496 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PAGR1Q9BTK6 254 aa30.42■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 H0YGN5 161 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 RFX1P22670 979 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 POLD1P28340 1107 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 MDH1P40925 334 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 BAG6P46379 1132 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 FAM178BQ8IXR5 827 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 EHMT1Q9H9B1 1298 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 NFS1Q9Y697 457 aa30.41■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 YDJCA8MPS7 323 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PPIP5K2O43314 1243 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 BIRC3Q13489 604 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 RUFY4Q6ZNE9 571 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 GLYCTKQ8IVS8 523 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 RABEP2Q9H5N1 569 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 FAM114A2Q9NRY5 505 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 JAG1P78504 1218 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R5EQ16537 467 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PTPROQ16827 1216 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PACS2Q86VP3 889 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 SLC35G2Q8TBE7 412 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 WDR11Q9BZH6 1224 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 APEX2Q9UBZ4 518 aa30.4■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PRG0 241 aa30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms