RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 GRIN3BO60391 1043 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SPARCL1Q14515 664 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 NXNQ6DKJ4 435 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 HDAC11Q96DB2 347 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 GINS2Q9Y248 185 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 TSPY1Q01534 308 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 JADE1Q6IE81 842 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 ELMOD1Q8N336 334 aa9.67□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 EFCC1Q9HA90 598 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.67□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 USP17L10C9JJH3 530 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 PSMA2P25787 234 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 IQCB1Q15051 598 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 TRADDQ15628 312 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB18Q99592 522 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PPFIA2O75334 1257 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 IL18RAPO95256 599 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 NR1D1P20393 614 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 MTERF2Q49AM1 385 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 KRT35Q92764 455 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 GDF11O95390 407 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 VAMP7P51809 220 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 MAPRE2Q15555 327 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PDXDC1Q6P996 788 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 PSMB7Q99436 277 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 DMTNQ08495 405 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 NR5A1Q13285 461 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 MGARPQ8TDB4 240 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP69A5D8W1 941 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 KRT16P08779 473 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 MAP2K2P36507 400 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 H3BRJ5 948 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SPAG6O75602 509 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 C12orf60Q5U649 245 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 SNF8Q96H20 258 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PPLO60437 1756 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CHUKO15111 745 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 TMED2Q15363 201 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF699Q32M78 642 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PARVAQ9NVD7 372 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 LRRD1A4D1F6 860 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP73A6NFT4 308 aa9.65□□□□□ -0.86
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