RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 DDIT3P35638 169 aa17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 OSBP2Q969R2 916 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 E2F6O75461 281 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 SNX25Q9H3E2 840 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 DSG1Q02413 1049 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 HEMGNQ9BXL5 484 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 RGL1Q9NZL6 768 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 WDR64B1ANS9 1081 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 XKR9Q5GH70 373 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PDXDC1Q6P996 788 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 IL17REQ8NFR9 667 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 SLC12A1Q13621 1099 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 DACH2Q96NX9 599 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 THTPAQ9BU02 230 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 H0Y626 953 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CDH16O75309 829 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 SERPINB1P30740 379 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 MXI1P50539 228 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 LRRC34Q8IZ02 419 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 LONRF1Q17RB8 773 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 STK36Q9NRP7 1315 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PLA2G4BP0C869 781 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 EP400NLQ6ZTU2 488 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ATP11CQ8NB49 1132 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ACCSQ96QU6 501 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TSSK1BQ9BXA7 367 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8MH3BSY2 632 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 APBA3O96018 575 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZBED8Q8IZ13 594 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZBED1O96006 694 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ARHGDIAP52565 204 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ADORA1P30542 326 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 MDM1Q8TC05 714 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 WDR70Q9NW82 654 aa17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 SYNMO15061 1565 aa17.09■□□□□ 0.33
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