RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF263O14978 683 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KCNJ12Q14500 433 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC38Q502W7 563 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ODF2Q5BJF6 829 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 WHAMMQ8TF30 809 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 BICD1Q96G01 975 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PIGSQ96S52 555 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 CABP5Q9NP86 173 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ADM5C9JUS6 153 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KIF5AQ12840 1032 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TRIM29Q14134 588 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KANK3Q6NY19 840 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PDHA1P08559 390 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KRT16P08779 473 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 RARAP10276 462 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MDM1Q8TC05 714 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 F5H6K3 240 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PDLIM1O00151 329 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TACC1O75410 805 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 CAP2P40123 477 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 POLE2P56282 527 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KLRC3Q07444 240 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TNFAIP1Q13829 316 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 RNF220Q5VTB9 566 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MMP1P03956 469 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SCG2P13521 617 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PAFAH1B1P43034 410 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 BIRC3Q13489 604 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PPP2R5BQ15173 497 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SLX1AQ9BQ83 275 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 POTEIP0CG38 1075 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 POTEJP0CG39 1038 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ITIH4Q14624 930 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SLFN13Q68D06 897 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MYH4Q9Y623 1939 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ABLIM1O14639 778 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 UBOX5O94941 541 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SLC1A4P43007 532 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF543Q08ER8 600 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 NPY5RQ15761 445 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 NYAP2Q9P242 653 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MYH6P13533 1939 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 USP17L10C9JJH3 530 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ATP6V1G1O75348 118 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 NDUFB10O96000 172 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MB21D1Q8N884 522 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PAGE5Q96GU1 130 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SH2D4AQ9H788 454 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 OATP04181 439 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SNHG28P0DPA3 235 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 SPAG1Q07617 926 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 PHC3Q8NDX5 983 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 COA7Q96BR5 231 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 CSRNP2Q9H175 543 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ECT2Q9H8V3 914 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 WNT7AO00755 349 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms