RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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GABPB1-201ENST00000220429 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.056e-6■□□□□ 10
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GABPB1-201ENST00000220429 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.72□□□□□ -0.05
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GABPB1-201ENST00000220429 GDAQ9Y2T3 454 aa14.72□□□□□ -0.05
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GABPB1-201ENST00000220429 SLURP2P0DP57 97 aa14.71□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SESN3P58005 492 aa14.71□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 NFIAQ12857 509 aa14.71□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.71□□□□□ -0.06
GABPB1-201ENST00000220429 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.71□□□□□ -0.06
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