RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 PEX3P56589 373 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 CDK17Q00537 523 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 Q3C1V9 767 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 POTEB2H3BUK9 544 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 SLC16A4O15374 487 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 PSAPP07602 524 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 NFIL3Q16649 462 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 CEP170P1Q96L14 293 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 GANQ9H2C0 597 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 DMAC2Q9NW81 257 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 ARID2Q68CP9 1835 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 TLR2O60603 784 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 PGK2P07205 417 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC42Q96M95 316 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.39■□□□□ 0.86
SIKE1-201ENST00000060969 SCN4AP35499 1836 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PRKCEQ02156 737 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SLC35F6Q8N357 371 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 DRC1Q96MC2 740 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MAF1Q9H063 256 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 HGSNATQ68CP4 663 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 RDH13Q8NBN7 331 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 BSNDQ8WZ55 320 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PON1P27169 355 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ICAM3P32942 547 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 KIAA1328Q86T90 577 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM49P0CI25 452 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM49CP0CI26 452 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EDNRBP24530 442 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 KIF11P52732 1056 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 KRT83P78385 493 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.37■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC169A6NNP5 214 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 EXOC3O60645 756 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 NCKAP1LP55160 1127 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GTF2BQ00403 316 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ARID5AQ03989 594 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ACCSQ96QU6 501 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TIPINQ9BVW5 301 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GCNT4Q9P109 453 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ATP4AP20648 1035 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 NPTX2P47972 431 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FGD4Q96M96 766 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 DEF6Q9H4E7 631 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.36■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CYP2C8P10632 490 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms