RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp4P35123 962 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbx22Q8K402 517 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Opa1P58281 960 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pbxip1Q3TVI8 727 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Celf4Q7TSY6 486 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spdl1Q923A2 608 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsnaxip1Q99P25 704 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc40a1Q9JHI9 570 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prss51A0A286YDY8 319 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10110D3Z5M2 615 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpina1aP07758 413 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpina1bP22599 413 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpina1cQ00896 412 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpina1dQ00897 413 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Btnl9Q8BJE2 536 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nr2e1Q64104 385 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Git1Q68FF6 770 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf354bQ9QXT9 601 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp11b2P15539 500 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NfibP97863 570 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srrm3Q80WV7 648 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P3h4Q8K2B0 443 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rabl3Q9D4V7 236 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnh7Q9ER47 1195 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scfd2Q8BTY8 684 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Defb15Q8R2I5 79 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ctage5Q8R311 779 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rasgef1cQ9D300 466 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IvdQ9JHI5 424 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scgb2b7D3YYY1 112 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Magea4F2Z493 315 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lmntd2Q0VET5 664 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tspyl5Q69ZB3 406 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Msantd2Q6NZR2 559 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lmo3Q8BZL8 145 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kmt2eQ3UG20 1868 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm28510A0A087WP28 240 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinb8O08800 374 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frmd8Q3UFK8 466 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tspyl3Q3UYP3 334 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AdalQ80SY6 360 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ints2Q80UK8 1198 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc17a8Q8BFU8 601 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam228aQ8CDW1 299 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dr1Q91WV0 176 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Osbpl7A2A716 963 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo1fP70248 1099 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P4ha1Q60715 534 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stxbp2Q64324 593 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Senp6Q6P7W0 1132 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh3d21Q7TSG5 549 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NrcamQ810U4 1256 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc18a1Q8R090 521 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tagap1P0CAX8 505 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgfr1opQ66JX5 399 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tas2r134Q7TQB0 298 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pja2Q80U04 707 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc20a2Q80UP8 656 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc5Q99LG4 440 aa28.42■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Skor2A7M7C7 1008 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm14525B1AZA0 212 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm2012B1B0R1 212 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm2030D3Z7C4 212 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp3caP63328 521 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ica1lQ3TY65 431 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm14819Q62478 212 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef25Q9CWR0 618 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GrapQ9CX99 217 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tjp3Q9QXY1 905 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cul1Q9WTX6 776 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q3TTJ4 293 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tax1bp1Q3UKC1 814 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zdhhc24Q6IR37 284 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sun2Q8BJS4 731 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q8BWG4 1187 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epn2Q8CHU3 595 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PpatQ8CIH9 517 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cfap57Q9D180 1249 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 C2cd2E9Q3C1 696 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gdap1O88741 358 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rit2P70425 217 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.9 ms