RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nup210lQ9D2F7 1881 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Surf1P09925 306 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Irf8P23611 424 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 DmpkP54265 631 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dcaf17Q3TUL7 519 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Oog4Q4G0C7 502 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 R3hdm4Q4VBF2 262 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mkrn3Q60764 544 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 TbckQ8BM85 762 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tekt1Q9DAJ2 418 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cnga3Q9JJZ8 631 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Taf1Q80UV9 1891 aa17.59■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prl6a1O35257 230 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01734 135 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 RdxP26043 583 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klrb1bP27812 223 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Irs1P35569 1233 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fscn2Q32M02 492 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Frmd8Q3UFK8 466 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm5169Q5M8P2 212 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Celf3Q8CIN6 465 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf131Q8K3J5 619 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 CbsQ91WT9 561 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf704Q9ERQ3 566 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx25Q9QY15 484 aa17.58■□□□□ 0.41
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Apol6B7ZC55 329 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gimap9G3X987 291 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 GclmO09172 274 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Men1O88559 611 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mtco1P00397 514 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 GcP21614 476 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 AdssP46664 456 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abcd1P48410 736 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Serpina1eQ00898 413 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gzf1Q4VBD9 706 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp90Q61967 636 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp6nlQ80XC3 819 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Haus4Q8BFT2 363 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dpp9Q8BVG4 862 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppme1Q8BVQ5 386 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc142Q8CAI1 738 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 MafaQ8CF90 359 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 AagabQ8R2R3 316 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Acot11Q8VHQ9 594 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 GldcQ91W43 1025 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 BrdtQ91Y44 956 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tlr5Q9JLF7 859 aa17.58■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sec14l1A8Y5H7 715 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm8298J3QPI0 401 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tlr13Q6R5N8 991 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mamdc2Q8CG85 686 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam122aQ9DB52 284 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc15a2Q9ES07 729 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Syt5Q9R0N5 386 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klra10Q9R1G6 266 aa17.57■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Taf4bG5E8Z2 855 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pgrmc1O55022 195 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wnt7bP28047 349 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tnni3P48787 211 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rbp3P49194 1234 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mcl1P97287 331 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Panx2Q6IMP4 677 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Acot5Q6Q2Z6 421 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ano5Q75UR0 904 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 PodnQ7TQ62 611 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 H2-Q4Q8HWB2 354 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem206Q9D771 350 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Egfl6Q9JJZ5 550 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Msgn1Q9JK54 188 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnajc7Q9QYI3 494 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Otud7bB2RUR8 840 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Clca3bE9PUL3 1044 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nptx2O70340 429 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Phka1P18826 1241 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adamts19P59509 1210 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Agxt2Q3UEG6 513 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdr18Q4VBE8 431 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 DeptorQ570Y9 409 aa17.56■□□□□ 0.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 Icam5Q60625 917 aa17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31 ms