RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 HACL1Q9UJ83 578 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB7AO95365 584 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PRKCIP41743 596 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 JAK3P52333 1124 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 KCNA1Q09470 495 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MTMR2Q13614 643 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 NAB2Q15742 525 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RUBCNQ92622 972 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 DMAC2Q9NW81 257 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RNF14Q9UBS8 474 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SFNP31947 248 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ARID5AQ03989 594 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 DMTNQ08495 405 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 IL31RAQ8NI17 732 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 STRA6Q9BX79 667 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 POLD4Q9HCU8 107 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PICK1Q9NRD5 415 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SAMM50Q9Y512 469 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 DOCK1Q14185 1865 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MAP2K7O14733 419 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ACTN1P12814 892 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 FERP16591 822 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 VSNL1P62760 191 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PGM5Q15124 567 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RDM1Q8NG50 284 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PPP1R37O75864 691 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SASH3O75995 380 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 GFPT2O94808 682 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PAFAH1B1P43034 410 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 OAZ1P54368 228 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 BACE1P56817 501 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 KRT76Q01546 638 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 APBA1Q02410 837 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 CCDC181Q5TID7 509 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ACCSQ96QU6 501 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 IWS1Q96ST2 819 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RMDN3Q96TC7 470 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ABCB6Q9NP58 842 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 A0A087X0T9 212 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 K7ENM7 598 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 FZD9O00144 591 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 VWA5AO00534 786 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 EGFRP00533 1210 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 CCDC172P0C7W6 258 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 FAM228BP0C875 321 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 STAT1P42224 750 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 JAM2P57087 298 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MAPK7Q13164 816 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 CREG2Q8IUH2 290 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 C4orf19Q8IY42 314 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 DRC1Q96MC2 740 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MAF1Q9H063 256 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SIX2Q9NPC8 291 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PXMP2Q9NR77 195 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 MYH11P35749 1972 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 WDR64B1ANS9 1081 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 KRT13P13646 458 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms