RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 EDIL3O43854 480 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR32O75388 356 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADAM15Q13444 863 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRR33A8MZF0 331 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 IFNAR1P17181 557 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLCN3P51790 818 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 HCSTQ9UBK5 93 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD207Q9UJ71 328 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR64B1ANS9 1081 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 MSH4O15457 936 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCXO43602 365 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMA5P28066 241 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 NDUFV1P49821 464 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 EVCP57679 992 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM167AQ96KS9 214 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIOO75962 3097 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAGEB2O15479 319 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF862O60290 1169 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 NRIP1P48552 1158 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 DSC3Q14574 896 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 EFHBQ8N7U6 833 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 DISC1Q9NRI5 854 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLEC1BQ9P126 229 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 AKT3Q9Y243 479 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 REC8O95072 547 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 OATP04181 439 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 FGFR1P11362 822 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM189BP81408 668 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGCGQ16739 394 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 AAASQ9NRG9 546 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHMP2AO43633 222 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP11P51784 963 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKCEQ02156 737 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC5A5Q92911 643 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 GJA10Q969M2 543 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP7D2Q96T17 732 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CWH43Q9H720 699 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 GAS7O60861 476 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 FGF18O76093 207 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 EYA4O95677 639 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLP2RO95838 553 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMOD1P28289 359 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 NLRP5P59047 1200 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBE3AQ05086 875 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 RUFY3Q7L099 469 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 RIT2Q99578 217 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 TLR9Q9NR96 1032 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBCKQ8TEA7 893 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 PER2O15055 1255 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 SFNP31947 248 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 JAK3P52333 1124 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 ERVFC1P60507 584 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 COASYQ13057 564 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TLE6Q9H808 572 aa23.44■■□□□ 1.34
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