RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKDQ16760 1214 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 MTERF2Q49AM1 385 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 DAW1Q8N136 415 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RX5Q93086 422 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NJR5 290 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HBP1O60381 514 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 RTP1P59025 263 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPPQ6IPU0 288 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SARM1Q6SZW1 724 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MED15Q96RN5 788 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE4BO95155 1302 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY6O43306 1168 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ALCAMQ13740 583 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCB4Q15147 1175 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ODR4Q5SWX8 454 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TLK2Q86UE8 772 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM178BQ8IXR5 827 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS2O43903 313 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PLS3P13797 630 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC63Q05C16 580 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A3Q8WY07 619 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP89Q96ST8 783 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D3AQ9BRG2 576 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 BEGAINQ9BUH8 593 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 EVPLQ92817 2033 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CPT1AP50416 773 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 STX17P56962 302 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CAP1Q01518 475 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 BMT2Q1RMZ1 405 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM50Q86XT4 487 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 AP5M1Q9H0R1 490 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FANCLQ9NW38 375 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D7Q9P0N9 293 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SFI1A8K8P3 1242 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PXYLP1Q8TE99 480 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf70Q9BSU1 422 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD3B7Q9H2F3 369 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 COL1A2P08123 1366 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 EMC2Q15006 297 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM102BQ5T8I3 360 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TTI2Q6NXR4 508 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF507Q8TCN5 953 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SCFD1Q8WVM8 642 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FIZ1Q96SL8 496 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 DEKP35659 375 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF720Q7Z2F6 126 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TSG101Q99816 390 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MAFO75444 373 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GCNT3O95395 438 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGCRP04035 888 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF18P17022 549 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SCP2P22307 547 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGS1P23219 599 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MARK3P27448 753 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCD1P33897 745 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC41Q15345 812 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF484Q5JVG2 852 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MAEAQ7L5Y9 396 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPV1Q8NER1 839 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPC6Q9Y210 931 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BRB1 525 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT4O43236 478 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SMTNP53814 917 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GLIS3Q8NEA6 775 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RAET1EQ8TD07 263 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SPIRE2Q8WWL2 714 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY3O60266 1144 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCB2Q00722 1185 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAG1Q07617 926 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKAL1Q5VV42 579 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA6BQ9H3T3 888 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 POLD4Q9HCU8 107 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP5P51878 434 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PMS1P54277 932 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
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