RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	MATN2	O00339	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	TGM5	O43548	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CYP17A1	P05093	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	RGS3	P49796	1198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	NEK4	P51957	841 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	EPHA7	Q15375	998 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX11-208	ENST00000576084	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084		K7ESM1	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	KCNQ1	P51787	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GYS2	P54840	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CFHR4	Q92496	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084		Q9UFV3	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ANTXR2	P58335	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	DUSP8	Q13202	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NFYC	Q13952	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ICAM4	Q14773	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ZNF174	Q15697	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ZNF536	O15090	1300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	HMGCR	P04035	888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	STAT5B	P51692	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	RRAD	P55042	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	HGFAC	Q04756	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	RNF180	Q86T96	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PDE8A	O60658	829 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GAS7	O60861	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	HSD3B2	P26439	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ADAM17	P78536	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ROM1	Q03395	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LRRC32	Q14392	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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