RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 TRAPPC10P48553 1259 aa23.6■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 MCTP1Q6DN14 999 aa23.6■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 GPR182O15218 404 aa23.59■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.59■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 CEP170P1Q96L14 293 aa23.59■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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SNAP23-216ENST00000568331 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.54■■□□□ 1.36
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SNAP23-216ENST00000568331 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 ERVK-21P61565 698 aa23.53■■□□□ 1.36
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SNAP23-216ENST00000568331 ADGRE1Q14246 886 aa23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 NBR1Q14596 966 aa23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 ADAM2Q99965 735 aa23.53■■□□□ 1.36
SNAP23-216ENST00000568331 CDH23Q9H251 3354 aa23.53■■□□□ 1.36
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