RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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ADAMTS17-205ENST00000558960 LPIN1Q14693 890 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 RAB30Q15771 203 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP89Q96ST8 783 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 MSRAQ9UJ68 235 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 GINS2Q9Y248 185 aa23.47■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM150BA6NC51 233 aa23.46■■□□□ 1.35
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ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT79Q5XKE5 535 aa23.46■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.46■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.46■■□□□ 1.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.46■■□□□ 1.35
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ADAMTS17-205ENST00000558960 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.45■■□□□ 1.34
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ADAMTS17-205ENST00000558960 BECN1Q14457 450 aa23.45■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCP11Q8WWU5 503 aa23.45■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 TET1Q8NFU7 2136 aa23.45■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 EVPLQ92817 2033 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPR182O15218 404 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPR32O75388 356 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 MED24O75448 989 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPS6KA5O75582 802 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 RESTQ13127 1097 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 PAK2Q13177 524 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 KIZQ2M2Z5 673 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCLT1Q96NL6 688 aa23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ASAP2O43150 1006 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 DGAT1O75907 488 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD52P31358 61 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 PADI3Q9ULW8 664 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.43■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBTB39O15060 712 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 DNAJB2P25686 324 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPC3P51654 580 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF410Q86VK4 478 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 NLRP7Q8WX94 980 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 AK8Q96MA6 479 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 MTRQ99707 1265 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 PBX4Q9BYU1 374 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 RARRES1P49788 294 aa23.41■■□□□ 1.34
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ADAMTS17-205ENST00000558960 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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ADAMTS17-205ENST00000558960 TCTN1Q2MV58 587 aa23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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ADAMTS17-205ENST00000558960 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 TIFAQ96CG3 184 aa23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.41■■□□□ 1.34
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ADAMTS17-205ENST00000558960 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.41■■□□□ 1.34
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ADAMTS17-205ENST00000558960 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 IL17AQ16552 155 aa23.4■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.4■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.4■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 DNM3Q9UQ16 869 aa23.4■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 LAMA3Q16787 3333 aa23.4■■□□□ 1.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 ENPP3O14638 875 aa23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC26A4O43511 780 aa23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 TLL1O43897 1013 aa23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 DEFB103AP81534 67 aa23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 DRP2Q13474 957 aa23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.39■■□□□ 1.33
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