RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 DNM2P50570 870 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 GPNMBQ14956 572 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPAQ15257 358 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NACC1Q96RE7 527 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 USP28Q96RU2 1077 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 PP2D1A8MPX8 630 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB39O15060 712 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 BAIAP3O94812 1187 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC34A2O95436 690 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 RARRES1P49788 294 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 EMC2Q15006 297 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 HERVK_113Q902F9 699 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SQORQ9Y6N5 450 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 VTNP04004 478 aa21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 GHRP10912 638 aa21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 USP38Q8NB14 1042 aa21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SEPT8Q92599 483 aa21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 GINS2Q9Y248 185 aa21.05■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 DGAT1O75907 488 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 BRD1O95696 1058 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC25AP30304 524 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC39A14Q15043 492 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 RASIP1Q5U651 963 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 APBB2Q92870 758 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SCLT1Q96NL6 688 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 MTRQ99707 1265 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBBXA8MT70 800 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC26A4O43511 780 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 EFCAB14O75071 495 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC42EP1Q00587 391 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 LPIN1Q14693 890 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 STK38Q15208 465 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 KIZQ2M2Z5 673 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ATL3Q6DD88 541 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC3P53804 2025 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 YEATS4O95619 227 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 UBA7P41226 1012 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 DRP2Q13474 957 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 IKBKEQ14164 716 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ECM1Q16610 540 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 HYIQ5T013 277 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 TCP11Q8WWU5 503 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 OSMRQ99650 979 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMA3Q16787 3333 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR32O75388 356 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNJ6P48051 423 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 GPC3P51654 580 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 CABP7Q86V35 215 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-208ENST00000558954 CALML4Q96GE6 196 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms