RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PANX2Q96RD6 677 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZNF302Q9NR11 478 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 USP20Q9Y2K6 914 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EXOC3O60645 756 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PLS3P13797 630 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ADORA2AP29274 412 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ARID5AQ03989 594 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 KCNH2Q12809 1159 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TMEM143Q96AN5 459 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DRC1Q96MC2 740 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CEP63Q96MT8 703 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 LYPLA2O95372 231 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CHMP4BP1P59074 171 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CCNA1P78396 465 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRIM14Q14142 442 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SPRYD7Q5W111 196 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 RRAGAQ7L523 313 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 MROH8Q9H579 483 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CPA4Q9UI42 421 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GNA14O95837 355 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ATP4AP20648 1035 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 STAT5BP51692 787 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NEDD9Q14511 834 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DPP9Q86TI2 863 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 BSNDQ8WZ55 320 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FGD4Q96M96 766 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DENND3A2RUS2 1198 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ACTN1P12814 892 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EDNRBP24530 442 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NPTX2P47972 431 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SMTNP53814 917 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 XKR3Q5GH77 459 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 RDM1Q8NG50 284 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NEK11Q8NG66 645 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TSC1Q92574 1164 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SPATA33Q96N06 139 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 AZI2Q9H6S1 392 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DNAI1Q9UI46 699 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TFR2Q9UP52 801 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NFASCO94856 1347 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 OTOFQ9HC10 1997 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FAM170AA1A519 330 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SOCS7O14512 581 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZSCAN12O43309 604 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ABL1P00519 1130 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CCDC175P0C221 793 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRIM49P0CI25 452 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms