RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	STBD1	O95210	358 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCNJ6	P48051	423 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLCN3	P51790	818 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NPEPPS	P55786	919 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NUCB2	P80303	420 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	IKBKE	Q14164	716 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MTR	Q99707	1265 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NBN	O60934	754 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	YEATS4	O95619	227 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	BRD1	O95696	1058 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CXCL10	P02778	98 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	EMC2	Q15006	297 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PTPA	Q15257	358 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SHH	Q15465	462 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CABP7	Q86V35	215 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPTLC2	O15270	562 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ASAP2	O43150	1006 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CHRNA1	P02708	482 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	VTN	P04004	478 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	GHR	P10912	638 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	RARRES1	P49788	294 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	EPHB4	P54760	987 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MGAT3	Q09327	533 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PAK2	Q13177	524 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	IL17A	Q16552	155 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZBTB39	O15060	712 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPR182	O15218	404 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPP6R2	O75170	966 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	EYA4	O95677	639 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDC25A	P30304	524 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRT85	P78386	507 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	PKP1	Q13835	747 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	TFDP1	Q14186	410 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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