RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 TMEM150BA6NC51 233 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 EML1O00423 815 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 DLL1O00548 723 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 STX6O43752 255 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 RPS6KA5O75582 802 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 RESTQ13127 1097 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 BECN1Q14457 450 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 ZNF174Q15697 407 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 MTERF2Q49AM1 385 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 POTEDQ86YR6 584 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 LRRC71Q8N4P6 559 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 MAP7D2Q96T17 732 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 AKT3Q9Y243 479 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.97■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 SIP14410 1827 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 CDH23Q9H251 3354 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 PDCP20941 246 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 TMOD1P28289 359 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 XKR3Q5GH77 459 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 HAS1Q92839 578 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 OSMRQ99650 979 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 VAV3Q9UKW4 847 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.96■□□□□ 0.15
LTBR-209ENST00000541102 LPXNO60711 386 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 STBD1O95210 358 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 MCM7P33993 719 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 PSMC5P62195 406 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 PPP2R5CQ13362 524 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 TMX1Q9H3N1 280 aa15.95■□□□□ 0.14
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LTBR-209ENST00000541102 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 WDR81Q562E7 1941 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.95■□□□□ 0.14
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LTBR-209ENST00000541102 GPR32O75388 356 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 EPC2Q52LR7 807 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 TTC38Q5R3I4 469 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 FIBCD1Q8N539 461 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 SCLT1Q96NL6 688 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 DENND3A2RUS2 1198 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 GPR182O15218 404 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 DDIT3P35638 169 aa15.93■□□□□ 0.14
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LTBR-209ENST00000541102 EPHA7Q15375 998 aa15.93■□□□□ 0.14
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LTBR-209ENST00000541102 ODR4Q5SWX8 454 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 PLA2G4FQ68DD2 849 aa15.93■□□□□ 0.14
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LTBR-209ENST00000541102 FAM228AQ86W67 206 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 TMEM192Q8IY95 271 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 ADAM2Q99965 735 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 RGL1Q9NZL6 768 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 TTC3P53804 2025 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 MGEA5O60502 916 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 STAG3L1P0CL83 205 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 NPEPPSP55786 919 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 DRP2Q13474 957 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-209ENST00000541102 GPM6BQ13491 265 aa15.92■□□□□ 0.14
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