RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516454.1

RNU6-659P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 659, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-659P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-659P-201ENST00000516454 HOXC12P31275 282 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CD83Q01151 205 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SF1Q15637 639 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 HTR3DQ70Z44 454 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 KCTD1Q719H9 257 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 HS2ST1Q7LGA3 356 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SH2D3CQ8N5H7 860 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CAGE1Q8TC20 777 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MYEOVQ96EZ4 313 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 INCENPQ9NQS7 918 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 DSEQ9UL01 958 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 UBE2QL1A1L167 161 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 GOLGA8BA8MQT2 603 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 HKR1P10072 659 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 GNAT1P11488 350 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 EPHA5P54756 1037 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SPIRE1Q08AE8 756 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 TESK1Q15569 626 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 DENND5AQ6IQ26 1287 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CCDC81Q6ZN84 652 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 PDPRQ8NCN5 879 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 WDR48Q8TAF3 677 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 WNK4Q96J92 1243 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 COQ10AQ96MF6 247 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CRBNQ96SW2 442 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 KCNJ15Q99712 375 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 WACQ9BTA9 647 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 DUSP26Q9BV47 211 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 GALNT8Q9NY28 637 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 EFR3BQ9Y2G0 817 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 LRP12Q9Y561 859 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 LRRC3CA6NJW4 275 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MAN2B1O00754 1011 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 BRD1O95696 1058 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CPP00450 1065 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SCG5P05408 212 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 GYPEP15421 78 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 HK1P19367 917 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 PTGS1P23219 599 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ADCY7P51828 1080 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 PTTG1IPP53801 180 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MOGSQ13724 837 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 STILQ15468 1287 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 PPP2R5EQ16537 467 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 BTBD8Q5XKL5 378 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM200BQ69YZ2 307 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ARHGEF19Q8IW93 802 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ANKRD53Q8N9V6 530 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 RGMAQ96B86 450 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 GPHA2Q96T91 129 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 TCF25Q9BQ70 676 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CD244Q9BZW8 370 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 VPS33BQ9H267 617 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 KMT5AQ9NQR1 393 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM200CA6NKL6 621 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 H3BNC9 293 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MSCO60682 206 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 IPO13O94829 963 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MC4RP32245 332 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ST5P78524 1137 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM189BP81408 668 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 VHLLQ6RSH7 139 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM145Q8NBT3 493 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MDGA1Q8NFP4 955 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 FCRL4Q96PJ5 515 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SLC6A15Q9H2J7 730 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 RIC8BQ9NVN3 520 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 AHRRA9YTQ3 701 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 TRIM24O15164 1050 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 C1QL1O75973 258 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 NAT2P11245 290 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 BPIFB4P59827 614 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 KRTAP10-5P60370 271 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 GRAMD4Q6IC98 578 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 MFSD5Q6N075 450 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 LRSAM1Q6UWE0 723 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 USP43Q70EL4 1123 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 DDB2Q92466 427 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 BTBD2Q9BX70 525 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SLC46A2Q9BY10 475 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 IL23AQ9NPF7 189 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 SEMA4GQ9NTN9 838 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 RCAN3Q9UKA8 241 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM90A27PA6NNH2 459 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-659P-201ENST00000516454 NDUFA10O95299 355 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms