RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 BORCS6Q96GS4 357 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 LXNQ9BS40 222 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PARVGQ9HBI0 331 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D12O60347 775 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GAP43P17677 238 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CYP2J2P51589 502 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TRAF1Q13077 416 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RASA3Q14644 834 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 HOOK2Q96ED9 719 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 NACC1Q96RE7 527 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MYH11P35749 1972 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TUBBP07437 444 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PRLRP16471 622 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ODR4Q5SWX8 454 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 POTEAQ6S8J7 498 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GBP6Q6ZN66 633 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RDH13Q8NBN7 331 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GCNT4Q9P109 453 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 BCS1LQ9Y276 419 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TRIM49P0CI25 452 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TRIM49CP0CI26 452 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CCDC181Q5TID7 509 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 IQCEQ6IPM2 695 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TMEM150BA6NC51 233 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TISP43B9A030 160 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ASNSP08243 561 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ALAS1P13196 640 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FAM83AQ86UY5 434 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 DAW1Q8N136 415 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G6O60733 806 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 HIP1RO75146 1068 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ICAM1P05362 532 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 HSD17B4P51659 736 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MAPK7Q13164 816 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GPATCH11Q8N954 259 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 GFPT2O94808 682 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ZNF131P52739 623 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PPARDQ03181 441 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CBWD6Q4V339 395 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FAM71BQ8TC56 605 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 NAGPAQ9UK23 515 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PAFAH1B1P43034 410 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 SPP2Q13103 211 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PADI6Q6TGC4 694 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-213ENST00000492657 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms