RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491426.3

PDE4DIP-216, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4DIP, Length 670 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIFAP3Q92845 792 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PARVGQ9HBI0 331 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 TMEM150BA6NC51 233 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 HIP1RO75146 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ADAMTS4O75173 837 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIF20AO95235 890 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PGK1P00558 417 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PSEN2P49810 448 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 BEX3Q00994 111 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MFSD10Q14728 455 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 RETREG2Q8NC44 543 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 TCP11Q8WWU5 503 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 HAS3O00219 553 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 CABYRO75952 493 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 GNAT1P11488 350 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 INSRRP14616 1297 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCD1P33897 745 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 DNM2P50570 870 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZNF131P52739 623 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 RTP1P59025 263 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 COASYQ13057 564 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PPFIA1Q13136 1202 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 EMC2Q15006 297 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ISM2Q6H9L7 571 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MYCT1Q8N699 235 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 IFT74Q96LB3 600 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 NRCAMQ92823 1304 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARID2Q68CP9 1835 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PLS3P13797 630 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 SCP2P22307 547 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 TMOD1P28289 359 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 SMTNP53814 917 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 EHHADHQ08426 723 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PPP2R5AQ15172 486 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 KCNA10Q16322 511 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 IER5Q5VY09 327 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 LHX8Q68G74 356 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 KAT2BQ92831 832 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 CEP89Q96ST8 783 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PCNTO95613 3336 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MYADML2A6NDP7 307 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 H0YCG3 227 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ASAP2O43150 1006 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ASGR1P07306 291 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCL5P13501 91 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ALCAMQ13740 583 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 LRRC41Q15345 812 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 GRIK4Q16099 956 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 ODR4Q5SWX8 454 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 C7orf31Q8N865 590 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 KBTBD13C9JR72 458 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 PSMA7O14818 248 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 RSPH10BP0C881 870 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 CAPN2P17655 700 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 BMP6P22004 513 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 KLRC1P26715 233 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZNF165P49910 485 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 CHMP4BP1P59074 171 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms