RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	CKM	P06732	381 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	SURF1	Q15526	300 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	PALM2	Q8IXS6	379 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q8TCH9	128 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	OSBP2	Q969R2	916 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	TINF2	Q9BSI4	451 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP32	Q8NFA0	1604 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	BLACE	A4D250	179 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACOT7	O00154	380 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	AMH	P03971	560 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	GLI3	P10071	1580 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	TACR2	P21452	398 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	TUSC3	Q13454	348 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	VPS72	Q15906	364 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP53	Q70EK8	1073 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	EP400	Q96L91	3159 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	SBNO1	A3KN83	1393 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNRNP40-205	ENST00000486941	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXS1	O43638	330 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAH	P16930	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	CSF2RB	P32927	897 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q6ZUG5	572 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGEF10	O15013	1369 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	DLC1	Q96QB1	1528 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM83G	A6ND36	823 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLSCR1	O15162	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLF4	O43474	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF623	O75123	536 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	GLRB	P48167	497 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PFKP	Q01813	784 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRAM1	Q96QH2	718 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPN3	Q9H201	632 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	DLL4	Q9NR61	685 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	POGK	Q9P215	609 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABCA3	Q99758	1704 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRODH	O43272	600 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	CD276	Q5ZPR3	534 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KATNBL1	Q9H079	304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRIT1	O00522	736 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SUV39H1	O43463	412 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYP7B1	O75881	506 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRK2	P25098	689 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRK3	P35626	688 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPHA5	P54756	1037 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDR2	Q16832	855 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	VPS37D	Q86XT2	251 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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