RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 FOXN1O15353 648 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRD-211ENST00000486161 CYP3A4P08684 503 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 PTK2Q05397 1052 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
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PTPRD-211ENST00000486161 CDC25BP30305 580 aa9.01□□□□□ -0.97
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PTPRD-211ENST00000486161 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.01□□□□□ -0.97
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PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.01□□□□□ -0.97
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC15A5A6NIM6 579 aa9□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 TRPA1O75762 1119 aa9□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 CNTN2Q02246 1040 aa9□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 FUT2Q10981 343 aa9□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 SPRYD7Q5W111 196 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRD-211ENST00000486161 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRD-211ENST00000486161 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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