RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 GAS7O60861 476 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC9A1P19634 815 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 NME9Q86XW9 330 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 OR14A2Q96R54 314 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 OR10A2Q9H208 303 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 CD248Q9HCU0 757 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 IFT57Q9NWB7 429 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 DVL2O14641 736 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXS1O43638 330 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 PRLP01236 227 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 RGS3P49796 1198 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TKFCQ3LXA3 575 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TTC38Q5R3I4 469 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 Q8TCH9 128 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TOMM22Q9NS69 142 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 USP35Q9P2H5 1018 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 MUSKO15146 869 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 APOL3O95236 402 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TBR1Q16650 682 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 NIM1KQ8IY84 436 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 C7orf31Q8N865 590 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 NINJ1Q92982 152 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 MAML3Q96JK9 1138 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 OXSMQ9NWU1 459 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 JAG2Q9Y219 1238 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 COMTP21964 271 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAM15Q13444 863 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 NFYCQ13952 458 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 EPHA7Q15375 998 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 FUKQ8N0W3 1084 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 ADOQ96SZ5 270 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 FEZ1Q99689 392 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 RAD17O75943 681 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 DGKDQ16760 1214 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRED1Q7Z699 444 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 PASD1Q8IV76 773 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 NXPE1Q8N323 547 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 C16orf92Q96LL3 132 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 PLAAQ9Y263 795 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 VWA7Q9Y334 891 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 MATN2O00339 956 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 MAFGO15525 162 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC26A4O43511 780 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 ADCY1Q08828 1119 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF18BQ86Y91 864 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 F2P00734 622 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFRSF1AP19438 455 aa6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms