RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 AKT3Q9Y243 479 aa24.35■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 GPR32O75388 356 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 MMP1P03956 469 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 NPY5RQ15761 445 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 PLVAPQ9BX97 442 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.34■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 GPR182O15218 404 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 ITGB1P05556 798 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 JAK3P52333 1124 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 HYAL1Q12794 435 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 MAP7D2Q96T17 732 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 HCSTQ9UBK5 93 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.33■■□□□ 1.49
USP40-215ENST00000484528 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 M0R2N6 131 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 MAGEB2O15479 319 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 DNAJB1P25685 340 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 CAMK1Q14012 370 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 COL19A1Q14993 1142 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 CLUL1Q15846 466 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 Q4G0T1 1027 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 ODR4Q5SWX8 454 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 P2RX5Q93086 422 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 IGFLR1Q9H665 355 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 RGS18Q9NS28 235 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.32■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 TMEM150BA6NC51 233 aa24.31■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.31■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 C9IYK1 514 aa24.31■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 SFNP31947 248 aa24.31■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 SCRN1Q12765 414 aa24.31■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 INF2Q27J81 1249 aa24.31■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.31■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.31■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 LINC01565O15544 149 aa24.3■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 FGFR1P11362 822 aa24.3■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 IRS1P35568 1242 aa24.3■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 LTBRP36941 435 aa24.3■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.3■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 CYP3A7P24462 503 aa24.29■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 MTERF2Q49AM1 385 aa24.29■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa24.29■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 GJD3Q8N144 294 aa24.29■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 MBOAT7Q96N66 472 aa24.27■■□□□ 1.48
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USP40-215ENST00000484528 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.27■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 C5orf42Q9H799 3197 aa24.27■■□□□ 1.48
USP40-215ENST00000484528 FAM86C2PA6NEL3 165 aa24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 NCK2O43639 380 aa24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 CDKL5O76039 1030 aa24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 RDM1Q8NG50 284 aa24.26■■□□□ 1.47
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