RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	RASGRF1	Q13972	1273 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173		Q6ZRM9	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	PRRX2	Q99811	253 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNL1-223	ENST00000481173	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXN1	O15353	648 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	DNM2	P50570	870 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ADAM15	Q13444	863 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CRY1	Q16526	586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1W2PRX2	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	SCD	O00767	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	TM4SF20	Q53R12	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	VOPP1	Q96AW1	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ARVCF	O00192	962 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	IL12RB1	P42701	662 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ASB15	Q8WXK1	588 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PTPRN2	Q92932	1015 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GBP4	Q96PP9	640 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM20B	O75063	409 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PEX11B	O96011	259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	LMO1	P25800	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	RABGGTA	Q92696	567 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	RASSF10	A6NK89	507 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MAN2A2	P49641	1150 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GAREM2	Q75VX8	874 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MIEF2	Q96C03	454 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	DNAJC7	Q99615	494 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PCSK5	Q92824	1860 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GSTA4	O15217	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXP2	O15409	715 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	CRTAM	O95727	393 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PROZ	P22891	400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ADCY7	P51828	1080 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	RBL2	Q08999	1139 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	SERINC3	Q13530	473 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	RASA3	Q14644	834 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	C8orf37	Q96NL8	207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GPHA2	Q96T91	129 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	GPR87	Q9BY21	358 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	SNTG2	Q9NY99	539 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCNL1-223	ENST00000481173	NUDT3	O95989	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNL1-223	ENST00000481173	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CCNL1-223	ENST00000481173	GABRE	P78334	506 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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